海娜粉染发剂的缺点有：
1、色差大。就是说染出来的头发颜色与目标色差距大。因为海娜粉染发剂是一个物理过程，是直接将色素覆盖于头发外部的，而化学染发剂是将头发本身的色素除去，然后让色素进入头发内。由于海娜粉染发剂并不清除头发本身的色素，所以会造成染出的头发与目标色有色差。
2、颜色单调。海娜粉染发剂的色调主要是红色的，一些黄色系的根本无法靠海娜粉染发剂染出，这就是致命伤，不能随心所欲的选择自己喜欢的颜3、褪色快。纯植物染发剂都有这个缺点，海娜粉染发剂也不例外，如果褪色不严重那就一定时化学染发剂了。曾有过“越好的染发剂褪色越快”的说法，并不是没有道理的。海娜粉染发剂主要将色素附着于头发发丝表面，经过洗发水经常洗涤，很快就会褪色。
4、容易伤发质。头发容易变粗变脆，因为颜色是附着在头发毛鳞片上面，越染头发会越粗。而一些传统染发剂色素是在发丝里面的，不会造成头发变粗。还会损害毛鳞片，让头发更加脆弱不堪，头发的造型也会更加有难度。